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NEWS文献导读 | 人生就是博:PhIP-seq技术在复杂感染性疾病中的应用与研究
来源:太叔逸善 日期:2025-03-162019年11月,加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》杂志上发表了一项研究,探讨肠道病毒感染与儿童急性无力脊髓炎(AFM)的关系。研究中采用了PhIP-seq技术,借助病毒组抗原库对42名确诊为AFM的儿童以及58名患有其他神经系统疾病的对照组儿童的脑脊液样本进行分析,筛查与AFM病因相关的病毒特异性抗体。
研究结果表明, AFM患者组中肠道病毒抗体的富集现象得到了证实,并通过ELISA方法进行了验证。这一发现暗示,肠道病毒感染可能是造成研究中大多数AFM病例的主要原因。此研究为肠道病毒脑脊液抗体的快速检测提供了重要的参考,有助于未来对肠道病毒相关的AFM进行有效的临床诊断。
急性无力脊髓炎(AFM)于2012年首次在美国被发现,随后已导致超过500名儿童罹患该病。每两年发生一次的爆发期通常与肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的流行相关。然而,AFM的确切病因仍然难以确认,因为在少于50%的患者样本中(如鼻咽或口咽拭子)可检测到肠道病毒,仅约2%的AFM儿童脑脊液中发现肠道病毒的核酸。
为了解决这一问题,研究者们采用PhIP-seq技术分析了AFM儿童及对照组的脑脊液病毒抗体谱。这种技术能够高通量检测数百种病毒的特异性抗体,最终通过ELISA实验对结果进行了验证。
结果一:分析显示AFM组患儿特有的抗体反应主要集中在小RNA病毒(Picornaviridae)科中的肠病毒(Enterovirus)属,且其抗体在抗原库中显著高于对照组样本。
结果二:数据分析表明,免疫原性抗原肽段来源于整个肠道病毒基因组的蛋白质,且PhIP-seq技术不仅能够鉴定已知的线性表位序列,还能发现新的线性结合表位。
结果三:通过EV病毒VP1蛋白进行的ELISA验证显示,与对照组相比,AFM患儿组的脑脊液样本中大多数均能检测到EV信号,验证了PhIP-seq的检测结果。
噬菌体免疫沉淀测序(Phage-immunoprecipitation sequencing, PhIP-seq)是一种高通量抗体谱检测方法,结合了高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序技术。这项技术能够针对数十万种抗原进行血清抗体检测,绘制全面的抗体谱,并为免疫力相关研究提供强有力的工具。
在这一技术中,首先选择目标抗原数据库,然后通过生物信息分析将每个蛋白切分为重叠的肽段。接着,根据肽段序列合成DNA寡核苷酸并连接到载体,最终包装成噬菌体展示多肽库。样本血清与多肽抗原库孵育后,通过磁珠对抗体特异性的噬菌体进行富集,并进行后续的PCR扩增、建库及测序,最终解析血液中的抗体表位谱。
抗码芯瑞生物科技有限公司(简称“抗码芯瑞”)致力于抗体组学前沿技术的持续开发与成果转化,拥有超过20年的研究经验。公司建立了PhIP-seq技术平台,提供定制抗原建库服务,并开展基于该平台的高通量筛选、数据分析及后续验证等技术服务,为抗体组学研究提供整体解决方案。
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